Den molekylära bakgrunden till blodproteiners multifunktionalitet

Bakgrund: Molekylära interaktioner ligger bakom alla levande system. Proteiner från eukaryota celler är ofta kovalent modifierade, dvs kovalent bundna till andra molekyler såsom glykaner (socker), lipider, fosfatgrupper m.m. Dessa kovalenta modifieringar har betydelse för hur proteinerna binder till andra molekyler. I det här projektet studerar vi hur hur kovalent bundna glykaner och konformationsförändringar i proteiner påverkar proteiners egenskaper och funktioner.

Studien: Vi studerar för närvarande huvudsakligen två proteiner som reglerar blodkoagulation men som har visat sig vara multifunktionella, antitrombin och protein C inhibitorn. Vi vill förstå hur proteinernas konformation (struktur) samt hur de kovalent bundna glykanerna påverkar dessa proteiners interaktioner med ligander och receptorer.

Metoder: 1) Biokemiska interaktionsstudier (t.ex. fluorimetriska och spektrofotometriska metoder samt Biacore). 2) Interaktionsstudier i cellbaserade system. 3) Bestämning av N- och O-glykosylering samt N- och O-glykanstrukturer med masspektroskopi.